- D. José Ignacio García Pérez, Rector.
- D.ª Encarnación Mellado Durán, Vicerrectora de Coordinación Académica y Proyección Internacional.
- D. Manuel Acosta Seró, Vicerrector de Formación Permanente y Cultura.
- D. ª M.ª del Carmen Pozo Muñoz, Vicerrectora de Calidad, Igualdad y Responsabilidad Social.
- D. Alejandro Carrasco Muñoz, Vicerrector para la Transformación Digital.
- D. Julio Ruiz Palmero, Vicerrector de Innovación Educativa y Campus Virtual.
- D. José Antonio Piedra Fernández, Vicerrector de Estudiantes.
- D. José Antonio Ordaz Sanz, Vicerrector de Postgrado.
- D. José Manuel Castro Jiménez, Director de la Sede Antonio Machado de Baeza.
- D.ª M.ª de la O Barroso González, Directora de la Sede Santa María de la Rábida.
- D.ª Concepción Travesedo de Castill, Directora de la Sede Tecnológica en Málaga.
- D.ª María José Trigueros Martín, Secretaria General.
- Dª. Ana Belén Madera Molano, Gerente
- D. Juan Jiménez Millán, Director del CEAI-UNIA (Centro Especializado de Apoyo a la Investigación).
- D. ª Alicia Fernández Rodríguez, representante del PTGAS.
Los cargos académicos de la UNIA son nombrados de entre el profesorado de las universidades andaluzas y actúan por delegación del Rector en aquellas materias propias de su competencia. Los docentes que ocupan cargos académicos, como todo el profesorado universitario, tienen régimen de exclusividad, por lo que no pueden ocupar puesto alguno en otro organismo o institución.